46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1992 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  66.08 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  58.82 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  58.24 
 
 		 191 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  57.06 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  50.78 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  25.65 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  28.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  26.29 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2497  putative lipoprotein  31.69 
 
 		 392 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700773  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  27.04 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3263  lipoprotein, putative  30.22 
 
 		 397 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3070  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  24.6 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  26.58 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  27.45 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  27.61 
 
 		 449 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  25.26 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  25.26 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  25.26 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  25.53 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  26.7 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  23.53 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1834  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 389 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  27.06 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3168  lipoprotein, putative  29.63 
 
 		 396 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  27.12 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  27.35 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  27.35 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  23.43 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  24.57 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  24.21 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  26.75 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 221 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 177 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  22.46 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>