49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4281 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  95.89 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  77.42 
 
 		 219 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  78.34 
 
 		 219 aa  333  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  70.51 
 
 		 218 aa  315  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  70.51 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  70.51 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  64.22 
 
 		 219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  59.82 
 
 		 221 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  63.78 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  62.5 
 
 		 220 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  59.73 
 
 		 223 aa  258  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  59.17 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  59.17 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  59.17 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  59.02 
 
 		 221 aa  254  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  59.02 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  58.72 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  56.87 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  56.94 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  59.07 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  57.49 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  58.62 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  60.95 
 
 		 169 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  47.91 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  44.98 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  41.1 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  35.94 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  35.94 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  35.23 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  37.57 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  35.23 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  30.53 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  34.55 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  33.81 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  27.63 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  22.01 
 
 		 449 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  29.91 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  34.09 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  32.95 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>