50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3560 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  65.13 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  59.63 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  59.63 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  59.63 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  57.84 
 
 		 219 aa  254  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  59.02 
 
 		 219 aa  254  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  55.5 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  53.49 
 
 		 219 aa  244  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  57.41 
 
 		 220 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  51.38 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  55.19 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  54.09 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  53.02 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  53.02 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  54.85 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  52.56 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  51.63 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  52.71 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  50.7 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  54.23 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  52.11 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  56.21 
 
 		 169 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  45.66 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  45.45 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  39.55 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  38.99 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  34.5 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  30.84 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  32.4 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  30.65 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  30.2 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  28.73 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  25.65 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  28.57 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  28.15 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  26.67 
 
 		 449 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  25.74 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  25.68 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>