19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1121 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  54.14 
 
 		 196 aa  220  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  58.33 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  58.05 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  57.4 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  56.9 
 
 		 199 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  53.59 
 
 		 190 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  25.16 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  28.57 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  28.87 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3263  lipoprotein, putative  24.32 
 
 		 397 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  25.34 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3070  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 395 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2497  putative lipoprotein  26.19 
 
 		 392 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  25 
 
 		 219 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  25.38 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>