35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2498 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  66.08 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  57.3 
 
 		 190 aa  210  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  58.28 
 
 		 195 aa  208  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  58.64 
 
 		 196 aa  207  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  53.63 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  55.83 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  27.94 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  29.61 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  26.97 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  27.63 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  27.86 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  27.78 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  32.31 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  27.81 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2497  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 392 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  27.46 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  28.66 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3070  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 395 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3263  lipoprotein, putative  29.85 
 
 		 397 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  23.03 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  27.89 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  26.19 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  23.68 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  24.67 
 
 		 224 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  24.67 
 
 		 224 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  24.67 
 
 		 224 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  27.35 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  21.71 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>