22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4157 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  361  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  68.36 
 
 		 186 aa  233  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  70.89 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  70.89 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  60.9 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  51.15 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  52.07 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  56.33 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  49.43 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  48.54 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  47.31 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  47.8 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  40.52 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  43.06 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  36.88 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  42.14 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  27.04 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>