22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1041 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  64.86 
 
 
183 aa  241  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  74.39 
 
 
184 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  50.89 
 
 
186 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  54 
 
 
183 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  52.63 
 
 
186 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  51.32 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  52.07 
 
 
182 aa  167  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  54.61 
 
 
172 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  44.17 
 
 
183 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  44.17 
 
 
183 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  43.2 
 
 
172 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  43.2 
 
 
172 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  51.88 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  39.87 
 
 
189 aa  131  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  45.1 
 
 
179 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  48.82 
 
 
183 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  39.62 
 
 
177 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  34.39 
 
 
161 aa  111  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1834  putative lipoprotein  28.35 
 
 
389 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  26.19 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  28.72 
 
 
230 aa  41.2  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>