20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2274 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  87.57 
 
 		 186 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  87.03 
 
 		 186 aa  303  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  68.36 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  63.87 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  53.94 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  50.89 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  53.05 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  53.21 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  56.96 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  50.29 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  47.06 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  44.12 
 
 		 172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  44.83 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  40.61 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  33.73 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  41.46 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  41.2  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>