20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0018 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  57.06 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  53.12 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  55.13 
 
 		 186 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  55.13 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  56.17 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  52.26 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  52.53 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  43.45 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  53.21 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  43.45 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  44.1 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  43.67 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  47.8 
 
 		 179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  41.82 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  44.51 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  45.62 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  33.95 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  37.06 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  30.22 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>