19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1836 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  62.09 
 
 
183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  62.64 
 
 
183 aa  224  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  48.54 
 
 
182 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  47.06 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  48.05 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  46.75 
 
 
186 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  46.41 
 
 
183 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  48.54 
 
 
184 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  46.1 
 
 
183 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  49.68 
 
 
184 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  48.89 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  35.15 
 
 
172 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  35.4 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  38.64 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  34.38 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  37.97 
 
 
179 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  31.65 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  34.39 
 
 
177 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>