20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2079 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  97.85 
 
 		 186 aa  337  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  87.57 
 
 		 186 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  66.48 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  61.94 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 183 aa  180  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  49.4 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  51.92 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  51.57 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  55.13 
 
 		 172 aa  164  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  51.18 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  47.06 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  45.88 
 
 		 172 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  45.68 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  43.45 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  34.81 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  40.24 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  24.2 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>