21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0530 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  34.87 
 
 		 186 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  34.87 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  34.39 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  38.69 
 
 		 183 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  36.03 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 184 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  27.44 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  32.93 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  33.13 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  28.65 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  32.87 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  25.88 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  23.43 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>