25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2978 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 172 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  25.7 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  31.33 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  29.75 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  30.19 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  25.93 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  25.75 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  27.63 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1993  hypothetical protein  26.53 
 
 		 374 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.644262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1122  lipoprotein, putative  26.56 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000681269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1834  putative lipoprotein  25.37 
 
 		 389 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  26.32 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2497  putative lipoprotein  27.07 
 
 		 392 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700773  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  28.24 
 
 		 332 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 186 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 186 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>