19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1493 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  96.17 
 
 
183 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  62.64 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  50.57 
 
 
182 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  52.66 
 
 
186 aa  174  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  52.26 
 
 
186 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  52.26 
 
 
186 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  49.67 
 
 
183 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  44.17 
 
 
184 aa  151  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  46.2 
 
 
183 aa  144  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  48.24 
 
 
184 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  44.23 
 
 
172 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  38.69 
 
 
172 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  36.9 
 
 
172 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  34.81 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  36.81 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  34.18 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  35.03 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  32.93 
 
 
161 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>