48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1252 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  71.17 
 
 		 221 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  62.78 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  62.5 
 
 		 219 aa  277  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  63.89 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  63.89 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  62.04 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  63.43 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  65.07 
 
 		 219 aa  274  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  63.03 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  63.27 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  60.55 
 
 		 224 aa  267  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  60.55 
 
 		 224 aa  267  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  60.55 
 
 		 224 aa  267  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  62.5 
 
 		 224 aa  267  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  65.12 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  57.41 
 
 		 221 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  62.56 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  59.22 
 
 		 224 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  57.75 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  59.61 
 
 		 224 aa  248  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 224 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 224 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 224 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  73.37 
 
 		 169 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  60.73 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  58.21 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  46.51 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  48.36 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  41.94 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  38 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  37 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  37 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  32.57 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  31.43 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  35.41 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  32.45 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  30.26 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  29.75 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  22.5 
 
 		 449 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  25.53 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  25.79 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  30.07 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>