29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1196 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  923    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  27.81 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  25.76 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  24.34 
 
 		 219 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  22.16 
 
 		 219 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  21.94 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  27.45 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  26.67 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  24.29 
 
 		 224 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  21.94 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  21.94 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  26.75 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  21.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  27.34 
 
 		 214 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  24.16 
 
 		 224 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  28.68 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  28.68 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  22.31 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  28.29 
 
 		 196 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 195 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  25.69 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  23.4 
 
 		 245 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  23.56 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  24.03 
 
 		 225 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  25.69 
 
 		 224 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  25.69 
 
 		 224 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  25.69 
 
 		 224 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  22.73 
 
 		 221 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>