101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1700 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1700  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
105 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3680  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  61.62 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0199113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4492  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.47 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169103  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0770  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.46 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235244  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4495  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.1 
 
 
100 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.42 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4929  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0126  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.53 
 
 
101 aa  84.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.71 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.71 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.38 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.9 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1624  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.39 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.34 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.36 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.23 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.38 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  32.97 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  37.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  36.36 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  36.36 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.26 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  39.56 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.35 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  39.78 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  39.78 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.3 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.56 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  30.23 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  38.54 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  29.29 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  29.29 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  37.36 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0399  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  40.86 
 
 
101 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  37.36 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  32.97 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  31.87 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.93 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  37.5 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2717  NADH dehydrogenase subunit K  39.78 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1335  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.68 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  32.97 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  29.59 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  28.28 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.48 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.69 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.61 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  31.87 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  28.28 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  35.16 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1356  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156431  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  34.04 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  34.04 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  34.41 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1576  NADH dehydrogenase subunit K  38.54 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343884  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  28.42 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0761  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.21 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000029481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  35.16 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  34.04 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  35 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.38 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0754034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3406  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.68 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.3 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
102 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  28.42 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  34.07 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  26.53 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  34.07 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
102 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  26.53 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.72 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
102 aa  42  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  27.27 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.57 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.03 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  26.53 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1628  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 
112 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
102 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.97 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.78 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  27.27 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  27.27 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  27.27 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.91 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  35.11 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  35.11 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  35.11 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.56 
 
 
102 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>