260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3680 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3680  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
101 aa  193  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0199113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4492  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  64.36 
 
 
100 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169103  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4495  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  62 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0770  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.41 
 
 
100 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1700  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.62 
 
 
105 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.24 
 
 
100 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4929  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0126  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.48 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.4 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.76 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.43 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.43 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  40 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  40 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.11 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1624  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.39 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.36 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.34 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  35.29 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  36.27 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  37.89 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  34.69 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  35.29 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  35.29 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  36.27 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  36.27 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2717  NADH dehydrogenase subunit K  43.01 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  40.66 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  35.29 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  40.66 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  40.66 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.38 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0399  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  43.01 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  34.31 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  39.13 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  36.26 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  34.69 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  35.16 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  36.26 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  35.16 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.17 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3406  NADH dehydrogenase subunit K  39 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  35.71 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.69 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.65 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.73 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  38.46 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  35.23 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1576  NADH dehydrogenase subunit K  38.95 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343884  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  33.67 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  38.04 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  34 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  35.16 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  35 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  32.97 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.65 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  34 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  34.29 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  34 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.29 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  35.16 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  34.07 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.61 
 
 
100 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.69 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.61 
 
 
100 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
104 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  32.35 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.66 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  32.35 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.98 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  32.35 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.37 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  33.67 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.37 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3404  F420H2 dehydrogenase subunit K  34.74 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143705  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.12 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.35 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  32.35 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>