243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1730 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01547  Acyl-CoA carboxylate CoA-transferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD33]  61.46 
 
 
525 aa  679    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0842  Acetyl-CoA hydrolase  73.8 
 
 
549 aa  809    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0174  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  90.96 
 
 
520 aa  995    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0490  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  73.9 
 
 
531 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2384  putative coenzyme A transferase  73.03 
 
 
519 aa  800    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000381077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1125  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  74.18 
 
 
531 aa  794    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1730  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 
520 aa  1074    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.65818  normal  0.284392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3044  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  73.9 
 
 
531 aa  802    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000816099  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3897  acetyl-CoA hydrolase/transferase  87.88 
 
 
520 aa  965    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1337  Acetyl-CoA hydrolase  73.03 
 
 
519 aa  813    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0485  Acetyl-CoA hydrolase  71.68 
 
 
531 aa  777    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0468  acetyl-CoA hydrolase/transferase  71.68 
 
 
531 aa  778    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0309318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0345  Acetyl-CoA hydrolase  70.29 
 
 
531 aa  766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000953536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4029  Acetyl-CoA hydrolase  72.76 
 
 
531 aa  791    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2843  acetyl-CoA hydrolase/transferase  71.29 
 
 
519 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3013  Acetyl-CoA hydrolase  89.42 
 
 
520 aa  980    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0286  Acetyl-CoA hydrolase  73.14 
 
 
531 aa  792    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.050064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1370  Acetyl-CoA hydrolase  71.48 
 
 
519 aa  794    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000044229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0795  acetyl-CoA hydrolase/transferase  73.8 
 
 
549 aa  807    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3982  Acetyl-CoA hydrolase  87.88 
 
 
520 aa  964    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000234474 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78208  Acetyl-CoA hydrolase (Acetyl-CoA deacylase) (Acetyl-CoA acylase)  57.47 
 
 
524 aa  615  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950828  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0301  succinate CoA transferase  45.9 
 
 
511 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.48 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1025  succinate CoA transferase  46.58 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.273752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2304  succinate CoA transferase  46.29 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0363976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0503  Acetyl-CoA hydrolase  45.83 
 
 
548 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636654  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4021  succinate CoA transferase  45.9 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205204  normal  0.45753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1909  Acetyl-CoA hydrolase  45.12 
 
 
504 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0538  succinate CoA transferase  46.3 
 
 
519 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0254  Acetyl-CoA hydrolase  47 
 
 
499 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  0.127915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0322  Acetyl-CoA hydrolase  46.02 
 
 
520 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461781  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0085  succinate CoA transferase  44.27 
 
 
504 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15880  acetyl-CoA hydrolase  44.55 
 
 
504 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.699182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0073  Acetyl-CoA hydrolase  44.92 
 
 
516 aa  435  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2071  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.51 
 
 
542 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189529  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4800  succinate CoA transferase  45.29 
 
 
510 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0678941  hitchhiker  0.0000783257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3540  Acetyl-CoA hydrolase  45.9 
 
 
504 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0100  Acetyl-CoA hydrolase  44.66 
 
 
507 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3051  putative succinyl-CoA/coenzyme A transferase  45.71 
 
 
496 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282197  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1763  coenzyme A transferase  45.51 
 
 
504 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2021  coenzyme A transferase  45.51 
 
 
504 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4466  succinate CoA transferase  45.61 
 
 
504 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388893  normal  0.939468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1903  coenzyme A transferase  45.31 
 
 
639 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0753  coenzyme A transferase  45.51 
 
 
504 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0696  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.51 
 
 
504 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194387  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4240  Acetyl-CoA hydrolase  45.7 
 
 
504 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1046  coenzyme A transferase  45.51 
 
 
504 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4126  Acetyl-CoA hydrolase  45.7 
 
 
504 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890881  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3393  succinate CoA transferase  45.7 
 
 
504 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0785  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.31 
 
 
504 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2146  Acetyl-CoA hydrolase  43.61 
 
 
504 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16440  acetyl-CoA hydrolase/transferase family  45.78 
 
 
498 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1227  Acetyl-CoA hydrolase  43.86 
 
 
516 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  44.64 
 
 
504 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1058  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.22 
 
 
496 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  43.81 
 
 
497 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1175  putative acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.66 
 
 
510 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.802387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1023  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.22 
 
 
496 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  45.29 
 
 
497 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  45.29 
 
 
497 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.92 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_002950  PG1013  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43 
 
 
498 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.442146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.42 
 
 
498 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.22 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  43.92 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1927  Acetyl-CoA hydrolase  43.36 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  43.92 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0516  coenzyme A transferase  42.38 
 
 
496 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0066  succinate CoA transferase  43.64 
 
 
506 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2477  Acetyl-CoA hydrolase  43.88 
 
 
510 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507052  normal  0.0950739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0397  Acetyl-CoA hydrolase  43.44 
 
 
504 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  44.31 
 
 
497 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  44.83 
 
 
504 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  44.34 
 
 
507 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0046  Acetyl-CoA hydrolase  43.44 
 
 
506 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.505771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2668  succinate CoA transferase  43.6 
 
 
510 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.48281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  44.31 
 
 
497 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0063  succinate CoA transferase  43.55 
 
 
506 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1288  Acetyl-CoA hydrolase  43.8 
 
 
510 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.64 
 
 
498 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2572  succinate CoA transferase  43.6 
 
 
510 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5077  succinate CoA transferase  43.53 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0771155  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0206  succinate CoA transferase  41.83 
 
 
498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3791  Acetyl-CoA hydrolase  43.55 
 
 
503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  42.44 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.61 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1400  succinate CoA transferase  43.8 
 
 
515 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.0306794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.41 
 
 
504 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1678  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  42.41 
 
 
504 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  42.47 
 
 
497 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1335  succinate CoA transferase  43.8 
 
 
515 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.311322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1704  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  42.22 
 
 
504 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.63 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  42.63 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.22 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1860  Acetyl-CoA hydrolase  44.31 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1900  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.22 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4895  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  42.66 
 
 
510 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1726  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.83 
 
 
504 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>