243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3897 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01547  Acyl-CoA carboxylate CoA-transferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD33]  61.66 
 
 		 525 aa  683    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0174  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  88.85 
 
 		 520 aa  975    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0490  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  73.71 
 
 		 531 aa  791    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0485  Acetyl-CoA hydrolase  71.87 
 
 		 531 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2384  putative coenzyme A transferase  71.68 
 
 		 519 aa  791    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000381077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1125  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  73.6 
 
 		 531 aa  782    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1730  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  87.88 
 
 		 520 aa  965    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.65818  normal  0.284392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3044  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  74.48 
 
 		 531 aa  800    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4029  Acetyl-CoA hydrolase  72.76 
 
 		 531 aa  788    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0842  Acetyl-CoA hydrolase  73.41 
 
 		 549 aa  796    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3982  Acetyl-CoA hydrolase  99.62 
 
 		 520 aa  1076    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000234474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0468  acetyl-CoA hydrolase/transferase  71.48 
 
 		 531 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0309318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3013  Acetyl-CoA hydrolase  90.77 
 
 		 520 aa  991    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1337  Acetyl-CoA hydrolase  71.87 
 
 		 519 aa  803    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2843  acetyl-CoA hydrolase/transferase  70.13 
 
 		 519 aa  785    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0795  acetyl-CoA hydrolase/transferase  73.03 
 
 		 549 aa  794    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0286  Acetyl-CoA hydrolase  71.62 
 
 		 531 aa  775    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.050064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1370  Acetyl-CoA hydrolase  70.33 
 
 		 519 aa  785    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000044229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3897  acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 		 520 aa  1078    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0345  Acetyl-CoA hydrolase  71.05 
 
 		 531 aa  767    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000953536  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78208  Acetyl-CoA hydrolase (Acetyl-CoA deacylase) (Acetyl-CoA acylase)  57.53 
 
 		 524 aa  618  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950828  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.75 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0503  Acetyl-CoA hydrolase  48.32 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0301  succinate CoA transferase  46.48 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1909  Acetyl-CoA hydrolase  46.88 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1025  succinate CoA transferase  47.36 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.273752  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4021  succinate CoA transferase  47.27 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205204  normal  0.45753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0322  Acetyl-CoA hydrolase  48.12 
 
 		 520 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0085  succinate CoA transferase  45.63 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2304  succinate CoA transferase  46.97 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0363976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0538  succinate CoA transferase  48.61 
 
 		 519 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0073  Acetyl-CoA hydrolase  46.18 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0254  Acetyl-CoA hydrolase  47.6 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  0.127915 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1763  coenzyme A transferase  46.68 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2071  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.68 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189529  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0696  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  46.68 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194387  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4240  Acetyl-CoA hydrolase  47.46 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3393  succinate CoA transferase  47.46 
 
 		 504 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1046  coenzyme A transferase  46.68 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2021  coenzyme A transferase  46.68 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3540  Acetyl-CoA hydrolase  47.27 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4126  Acetyl-CoA hydrolase  47.46 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890881  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0753  coenzyme A transferase  46.68 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15880  acetyl-CoA hydrolase  45.63 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.699182  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4466  succinate CoA transferase  46.98 
 
 		 504 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388893  normal  0.939468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1903  coenzyme A transferase  46.48 
 
 		 639 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0785  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  46.48 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3051  putative succinyl-CoA/coenzyme A transferase  46.71 
 
 		 496 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0100  Acetyl-CoA hydrolase  46 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1023  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  44.73 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1058  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  44.73 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1175  putative acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.42 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.802387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0066  succinate CoA transferase  45.4 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4800  succinate CoA transferase  45.38 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0678941  hitchhiker  0.0000783257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0397  Acetyl-CoA hydrolase  45.7 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1227  Acetyl-CoA hydrolase  45.61 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  45.79 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2146  Acetyl-CoA hydrolase  44.34 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0046  Acetyl-CoA hydrolase  45.21 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.505771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  46 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.88 
 
 		 498 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  43.9 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1927  Acetyl-CoA hydrolase  43.81 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0516  coenzyme A transferase  43.55 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16440  acetyl-CoA hydrolase/transferase family  45.01 
 
 		 498 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3791  Acetyl-CoA hydrolase  45.4 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  44.6 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  43.9 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  44.6 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  45.38 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  44.6 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  45.08 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  45.08 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0063  succinate CoA transferase  44.64 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.7 
 
 		 497 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2477  Acetyl-CoA hydrolase  43.77 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507052  normal  0.0950739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2668  succinate CoA transferase  43.5 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.48281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2572  succinate CoA transferase  43.5 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  44.09 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  44.34 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1288  Acetyl-CoA hydrolase  43.3 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  44.09 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5077  succinate CoA transferase  43.81 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0771155  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_002950  PG1013  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43 
 
 		 498 aa  412  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.442146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1678  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  43.5 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1860  Acetyl-CoA hydrolase  44.99 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4895  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  43.53 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  44.09 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.31 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.91 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1400  succinate CoA transferase  43.08 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.0306794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  43.11 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1704  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  42.91 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  43.61 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  41.96 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1335  succinate CoA transferase  43.08 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.311322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0206  succinate CoA transferase  42.6 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.91 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3000  succinate CoA transferase  44.42 
 
 		 505 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297289 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1900  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.52 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>