23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0345 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0345  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 109 aa  223  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0897014  normal  0.0328291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4487  hypothetical protein  65.14 
 
 		 109 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.111431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0058  CRISPR-associated protein Cas2  49.02 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3118  CRISPR-associated protein Cas2  50.53 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0402  CRISPR-associated protein Cas2  45.63 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0097  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.58 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104167  normal  0.518264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1694  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.67 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1873  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.67 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2008  CRISPR-associated protein Cas2  43 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.959025  normal  0.141931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0953  hypothetical protein  41.58 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1061  CRISPR-associated protein Cas2  46.46 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1232  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.56 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1904  hypothetical protein  47.56 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1475  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0329  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.18 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0711  hypothetical protein  42.16 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000727859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0896  oxidoreductase, putative  33.66 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0465757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0452  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.44 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220536  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0245  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1949  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22040  CRISPR-associated protein Cas2  31.58 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00451798 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2462  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196448  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf599  hypothetical protein  23.08 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000711932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>