23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0097 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0097  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 101 aa  214  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104167  normal  0.518264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0953  hypothetical protein  42.57 
 
 		 101 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0345  CRISPR-associated protein Cas2  41.58 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0897014  normal  0.0328291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2008  CRISPR-associated protein Cas2  43.14 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.959025  normal  0.141931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3118  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1232  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.59 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0402  CRISPR-associated protein Cas2  39.6 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4487  hypothetical protein  39.6 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.111431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0452  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1475  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.82 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0058  CRISPR-associated protein Cas2  39.22 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0896  oxidoreductase, putative  38.78 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0465757  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1949  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.62 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1904  hypothetical protein  38.61 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1873  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1694  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0329  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.64 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0711  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000727859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1061  CRISPR-associated protein Cas2  38.37 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0245  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.88 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2462  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.38 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22040  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00451798 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf599  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000711932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>