19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0452 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0452  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220536  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0953  hypothetical protein  40.57 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0097  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104167  normal  0.518264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0402  CRISPR-associated protein Cas2  46.25 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1232  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0345  CRISPR-associated protein Cas2  47.44 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0897014  normal  0.0328291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2008  CRISPR-associated protein Cas2  41.25 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.959025  normal  0.141931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3118  CRISPR-associated protein Cas2  41.46 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4487  hypothetical protein  43.04 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.111431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0058  CRISPR-associated protein Cas2  36.9 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0245  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.02 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1061  CRISPR-associated protein Cas2  36.59 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0329  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0711  hypothetical protein  28.42 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000727859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1904  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1873  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.07 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1694  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.07 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1475  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.38 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0896  oxidoreductase, putative  28.75 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0465757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>