19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1949 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1949  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 108 aa  223  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0097  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.62 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104167  normal  0.518264 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1904  hypothetical protein  32.73 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1232  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.72 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0402  CRISPR-associated protein Cas2  30.69 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4487  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.111431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0345  CRISPR-associated protein Cas2  31.96 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0897014  normal  0.0328291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2008  CRISPR-associated protein Cas2  29.41 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.959025  normal  0.141931 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1475  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.84 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0953  hypothetical protein  25.74 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0896  oxidoreductase, putative  28.87 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0465757  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0245  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.12 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0329  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.27 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2462  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.07 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1873  CRISPR-associated Cas2 family protein  21.98 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1694  CRISPR-associated Cas2 family protein  21.98 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3118  CRISPR-associated protein Cas2  23.81 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0711  hypothetical protein  22.22 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000727859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0058  CRISPR-associated protein Cas2  28.12 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>