19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2462 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2462  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 101 aa  200  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0953  hypothetical protein  37.93 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1232  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.56 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0245  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.47 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0402  CRISPR-associated protein Cas2  30.93 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3118  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1475  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.7 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0896  oxidoreductase, putative  28.71 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0465757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1904  hypothetical protein  32 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1949  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.07 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0097  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.38 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104167  normal  0.518264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0345  CRISPR-associated protein Cas2  36.47 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0897014  normal  0.0328291 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1061  CRISPR-associated protein Cas2  37.14 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1873  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.67 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1694  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.67 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0711  hypothetical protein  35.63 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000727859  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4487  hypothetical protein  30.93 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.111431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0058  CRISPR-associated protein Cas2  35.82 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0329  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>