62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0685 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0685    100 
 
 		 992 bp  1966    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  82.5 
 
 		 987 bp  571  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17760    86.25 
 
 		 534 bp  373  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.473105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  80.22 
 
 		 987 bp  371  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  80.94 
 
 		 1269 bp  236  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1429  hypothetical protein  82.88 
 
 		 582 bp  91.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17940    86.96 
 
 		 234 bp  87.7  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.679386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  87.84 
 
 		 999 bp  75.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  87.84 
 
 		 999 bp  75.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00970    87.32 
 
 		 231 bp  69.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  95.12 
 
 		 1446 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20950    83.87 
 
 		 351 bp  65.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  91.67 
 
 		 1098 bp  63.9  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  83.7 
 
 		 1077 bp  63.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  86.11 
 
 		 990 bp  63.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  83.7 
 
 		 1077 bp  63.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  83.7 
 
 		 1077 bp  63.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  83.7 
 
 		 1077 bp  63.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  83.7 
 
 		 1077 bp  63.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  88.89 
 
 		 1008 bp  60  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  84.93 
 
 		 990 bp  58  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0628    88.68 
 
 		 619 bp  58  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  84.93 
 
 		 990 bp  58  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  84.93 
 
 		 990 bp  58  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  83.75 
 
 		 957 bp  56  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  87.04 
 
 		 963 bp  52  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    92.11 
 
 		 3818 bp  52  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  88 
 
 		 993 bp  52  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  88 
 
 		 993 bp  52  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  88 
 
 		 1044 bp  52  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  88 
 
 		 993 bp  52  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  90.48 
 
 		 1023 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  87.04 
 
 		 1008 bp  52  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  87.04 
 
 		 1008 bp  52  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1176 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1176 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1158 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1176 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 720 bp  48.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22870    87.5 
 
 		 273 bp  48.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>