15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17760    100 
 
 		 534 bp  1059    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.473105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  98.44 
 
 		 1269 bp  710    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0685    86.25 
 
 		 992 bp  373  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  85 
 
 		 987 bp  349  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  83.08 
 
 		 987 bp  208  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  95.12 
 
 		 1446 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  92.86 
 
 		 1098 bp  60  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    89.8 
 
 		 3818 bp  58  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  89.58 
 
 		 990 bp  56  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0628    89.13 
 
 		 619 bp  52  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 1656 bp  48.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 1044 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 993 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 993 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 993 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>