29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1826 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  94.05 
 
 
185 aa  360  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  58.79 
 
 
180 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  59.44 
 
 
181 aa  215  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  58.01 
 
 
181 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  51.41 
 
 
182 aa  184  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  49.72 
 
 
181 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  51.55 
 
 
165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  46.93 
 
 
181 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  44.44 
 
 
193 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  41.44 
 
 
183 aa  143  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  35.29 
 
 
234 aa  67.8  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  57  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  31.4 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
373 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
351 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  36 
 
 
443 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
350 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2796  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
175 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 
710 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
298 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 
357 aa  41.2  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>