21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1246 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  563  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  49.4 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 		 198 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  33.99 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  33.58 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  33.56 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  38.68 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  38.21 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  31.76 
 
 		 181 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 194 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  33.12 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  29.79 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  31.71 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  22.48 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 165 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.107883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>