24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2302 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  100 
 
 
181 aa  373  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  54.55 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  53.63 
 
 
181 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  50.56 
 
 
180 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  49.72 
 
 
185 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  49.44 
 
 
182 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  50.62 
 
 
165 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
185 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  52 
 
 
181 aa  174  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  49.45 
 
 
193 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  41.38 
 
 
183 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  42.34 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  38.21 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  41.9 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 
194 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2808  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
180 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0459  hypothetical protein  36.19 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.107883 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
221 aa  41.6  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2424  HD-GYP domain-containing protein  27.07 
 
 
400 aa  41.2  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>