20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1286 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  100 
 
 
165 aa  336  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  55.28 
 
 
181 aa  177  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  54.04 
 
 
181 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  50.62 
 
 
181 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  51.55 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  51.55 
 
 
185 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  50.62 
 
 
180 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  50.62 
 
 
182 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  48.08 
 
 
181 aa  144  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  48.89 
 
 
193 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  41.25 
 
 
183 aa  122  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  39.42 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  31.71 
 
 
271 aa  57  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>