27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1620 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  100 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  74.44 
 
 		 181 aa  274  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  59.44 
 
 		 180 aa  217  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  59.44 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  59.44 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  54.71 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  53.63 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  53.14 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  54.04 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  48.85 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  44.12 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  42.99 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  33.12 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2796  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  32.23 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2808  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.107883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 692 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 710 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>