28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2393 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  94.05 
 
 		 185 aa  360  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  58.79 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  59.44 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  58.01 
 
 		 181 aa  204  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  53.07 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  50 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  51.55 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  46.33 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  46.37 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  42.54 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  34.19 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  36.51 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  32.23 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 373 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0732  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2796  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  37.66 
 
 		 443 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>