25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1685 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  74.44 
 
 		 181 aa  274  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  58.52 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  58.01 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  57.14 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  58.01 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  54.55 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  52 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  55.28 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  49.16 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  43.65 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 		 198 aa  94.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  38.51 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  31.76 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  40.5 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2808  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2796  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.107883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>