26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2713 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  38.7 
 
 
234 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  32.92 
 
 
271 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  41.83 
 
 
181 aa  94.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  32.78 
 
 
180 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  42.34 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
185 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  36.56 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  33.33 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  36.96 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  39.72 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  38.46 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  36.59 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.107883 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2796  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
194 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  29.84 
 
 
168 aa  52  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0459  hypothetical protein  27.52 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2808  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
350 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>