27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6170 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  266  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  75.54 
 
 
139 aa  179  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  60.29 
 
 
145 aa  146  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  68.75 
 
 
150 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  57.69 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  56.93 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  51.45 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  55.47 
 
 
132 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  52.55 
 
 
153 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  50.78 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  54.2 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  54.2 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  54.2 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  55.3 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18690  hypothetical protein  53.38 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2109  hypothetical protein  53.49 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141292  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3031  hypothetical protein  48.95 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  33.85 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  32.8 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  35.64 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  33.66 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0597  hypothetical protein  32.37 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  30.08 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.87 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  32.04 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  29.85 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>