22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1574 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  326  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  66.67 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  52.83 
 
 
172 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  56.88 
 
 
174 aa  157  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2577  hypothetical protein  56.17 
 
 
194 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  57.32 
 
 
158 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  48.47 
 
 
172 aa  141  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  34.06 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.62 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  32.86 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  34.09 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  29.86 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  34.51 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  34.51 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  34.51 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  30.33 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  36.46 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  31.2 
 
 
139 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50508  predicted protein  27.61 
 
 
381 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  28.68 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>