15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2442 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  337  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  55.63 
 
 
174 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  54.55 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  52.56 
 
 
158 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  48.47 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2577  hypothetical protein  60.13 
 
 
194 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  51.32 
 
 
177 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  48.33 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  43.33 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  32.26 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.36 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  36.17 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  36.17 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  36.17 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  31.39 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>