24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2285 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  345  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  66.67 
 
 
166 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  59.04 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  59.87 
 
 
158 aa  154  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2577  hypothetical protein  58.28 
 
 
194 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  51.32 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  50 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  37.14 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  39.81 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.37 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  35.34 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  32.8 
 
 
139 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  32.31 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50508  predicted protein  26.42 
 
 
381 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  34.59 
 
 
156 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  34.59 
 
 
156 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  34.59 
 
 
156 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  31.54 
 
 
136 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  35.2 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  39.58 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  33.59 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  38.95 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0042  hypothetical protein  30.08 
 
 
249 aa  41.6  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>