25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4354 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  332  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  59.04 
 
 
177 aa  160  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  57.05 
 
 
158 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  56.88 
 
 
166 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  55.63 
 
 
172 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  53.12 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2577  hypothetical protein  57.69 
 
 
194 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  36.8 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  32.33 
 
 
139 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0669  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.91 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  35.54 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  32.8 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  37.14 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  32.28 
 
 
139 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1546  hypothetical protein  33.02 
 
 
139 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0165489  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  34.26 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0153  hypothetical protein  24.81 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000234421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  36.13 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  38.55 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0152  hypothetical protein  28.99 
 
 
241 aa  40.8  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>