27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0448 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  266  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  65.62 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  58.09 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  53.28 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  53.03 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  57.25 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  54.55 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  50.77 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  52.34 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  52.67 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  52.67 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  52.67 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  53.03 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18690  hypothetical protein  49.63 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3031  hypothetical protein  45.45 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2109  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  37.38 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  29.32 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  31.06 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  32.04 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0597  hypothetical protein  36.81 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  35.19 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.72 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  32.82 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  35.71 
 
 		 172 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>