26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6827 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  280  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  59.4 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  59.71 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  56.92 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  55.22 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  51.08 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  51.15 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  53.79 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  51.52 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  46.27 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18690  hypothetical protein  46.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  34.56 
 
 		 177 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3031  hypothetical protein  42.25 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  35.16 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  31.09 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  33.85 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  32.29 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2109  hypothetical protein  41.43 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  30.59 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  27 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2577  hypothetical protein  33.6 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>