20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4580 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  77.55 
 
 		 148 aa  209  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0597  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  35.83 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  37.72 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  29.32 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  31.39 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  31.88 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  43.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1525  hypothetical protein  28.87 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.135501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  46.67 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  29.13 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.08 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4014  hypothetical protein  35.64 
 
 		 168 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.404496  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1546  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0165489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  31.15 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  32.48 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>