17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5222 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  100 
 
 
172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  52.83 
 
 
166 aa  150  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  54.55 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  52.83 
 
 
174 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  54.49 
 
 
158 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2577  hypothetical protein  46.5 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.2 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50508  predicted protein  33.59 
 
 
381 aa  51.2  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0153  hypothetical protein  24.11 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000234421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  36.19 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  30.14 
 
 
148 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  35.85 
 
 
136 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  29.13 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0042  hypothetical protein  29.03 
 
 
249 aa  44.7  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  31.5 
 
 
153 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>