23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  59.85 
 
 
145 aa  151  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  56.94 
 
 
153 aa  133  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  61.15 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  60.45 
 
 
144 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  53.28 
 
 
139 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  56.93 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  55.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  49.64 
 
 
161 aa  116  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  53.47 
 
 
153 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  58.39 
 
 
156 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  58.39 
 
 
156 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  58.39 
 
 
156 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  53.33 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18690  hypothetical protein  47.18 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  35.83 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3031  hypothetical protein  43.06 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  33.78 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2109  hypothetical protein  44.14 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  35.34 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  36.45 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  38.24 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>