23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5435 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5435  MORN repeat-containing protein  100 
 
 		 116 aa  236  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.416219  normal  0.0770205 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  29.35 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  30.86 
 
 		 770 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  35.21 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3064  hypothetical protein  27.59 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000702727  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  26.83 
 
 		 772 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  28.4 
 
 		 769 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  28.4 
 
 		 769 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  31.82 
 
 		 770 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3344  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  43.5  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000000293232  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  28.57 
 
 		 566 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 768 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  27.16 
 
 		 770 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  27.16 
 
 		 770 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  25.84 
 
 		 720 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  35.21 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  30.65 
 
 		 566 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  27.54 
 
 		 580 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  30.86 
 
 		 755 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  30.16 
 
 		 566 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  26.67 
 
 		 530 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.84 
 
 		 720 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  25.84 
 
 		 720 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>