More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3860 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
278 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  54.61 
 
 
278 aa  288  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.4 
 
 
280 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.74 
 
 
278 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.38 
 
 
278 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  50.92 
 
 
278 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  51.49 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  42.5 
 
 
280 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  42.55 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  40.56 
 
 
320 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  42.02 
 
 
274 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  43.17 
 
 
274 aa  185  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  42.86 
 
 
281 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  41.76 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.97 
 
 
276 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  44.24 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.38 
 
 
278 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
276 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
276 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.38 
 
 
278 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.57 
 
 
282 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
282 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
276 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  38.99 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.32 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  37.5 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.47 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.84 
 
 
277 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39 
 
 
286 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.79 
 
 
282 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  39.71 
 
 
277 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  38.55 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  38.55 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.76 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.92 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.32 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  35.25 
 
 
386 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
292 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.26 
 
 
282 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.37 
 
 
288 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  39.07 
 
 
274 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  40.23 
 
 
281 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
278 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 
269 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  39.93 
 
 
300 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
276 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
276 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
276 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.3 
 
 
286 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.34 
 
 
266 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
266 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.86 
 
 
274 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.83 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.36 
 
 
278 aa  151  8.999999999999999e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2082  undecaprenyl-diphosphatase  36.36 
 
 
286 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0924847  normal  0.0215547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.57 
 
 
277 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.13 
 
 
277 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  35.07 
 
 
290 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.91 
 
 
277 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.36 
 
 
274 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.36 
 
 
274 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  38.65 
 
 
274 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.43 
 
 
276 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
266 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.43 
 
 
283 aa  148  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  39.02 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.14 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.35 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  38.6 
 
 
285 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.43 
 
 
276 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.43 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  37.97 
 
 
261 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
268 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  39.84 
 
 
281 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  36.68 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.52 
 
 
278 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.88 
 
 
282 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  38.19 
 
 
290 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.44 
 
 
268 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
277 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  35.11 
 
 
289 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.1 
 
 
275 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.96 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.96 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.59 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.96 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.19 
 
 
268 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.55 
 
 
281 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.96 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.48 
 
 
268 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.76 
 
 
293 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.78 
 
 
276 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.78 
 
 
276 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.78 
 
 
276 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.78 
 
 
276 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>