More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4459 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 		 278 aa  549  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  81.29 
 
 		 278 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  73.38 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.4 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  54.64 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.74 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  46.79 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.52 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.52 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.52 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.09 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  48.01 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  47.16 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  46.67 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  46.45 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.57 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  45.32 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  41.7 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.62 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.39 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  42.6 
 
 		 272 aa  215  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.55 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.04 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  44.96 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.49 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  40.58 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.46 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  45.8 
 
 		 281 aa  208  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.96 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.81 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  43.45 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  41.33 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  41.72 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.21 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.88 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.65 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  40.91 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  43.17 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  40.89 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  38.55 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.58 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.72 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  38.43 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.21 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0157  undecaprenyl-diphosphatase  39.62 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.56 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  36.79 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.8 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0164  Undecaprenyl-diphosphatase  38.85 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.59 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.96 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  37.08 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.27 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  40.22 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0175  Undecaprenyl-diphosphatase  38.85 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.11 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.09 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  38.77 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.09 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  36.5 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.17 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.82 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.82 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.82 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.82 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  35.42 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  35.42 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  37.87 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.99 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  38.63 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  40.75 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.56 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  38.93 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.75 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.52 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.98 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.94 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  37.55 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.26 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  33.54 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.9 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.82 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.63 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.75 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>