45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4456 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4456  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0109  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  79.4 
 
 		 361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.880335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0546  hypothetical protein  27.88 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.02 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03228  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  35.14 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1366  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  35.14 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3496  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  37.88 
 
 		 183 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1039  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  37.88 
 
 		 183 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1698  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.31 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3368  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  37.88 
 
 		 183 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.559368  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.85 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2251  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.78 
 
 		 188 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.528378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0630  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  38.81 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3215  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.71 
 
 		 196 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0785446  normal  0.220404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.24 
 
 		 224 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1697  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.7 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3347  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.62 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0224  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.19 
 
 		 186 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2940  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  38.24 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0113  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.933893  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0103  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1955  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  40.74 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00108  hypothetical protein  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.78 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0116  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00925583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0158  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0166  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3492  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0160  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0159  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3549  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.337974  hitchhiker  0.00466113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00109  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0862231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0112  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000223729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0114  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000108993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3420  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.49 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0163  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0866  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  33.82 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0654  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  38.98 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.36 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 360 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.65 
 
 		 379 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1062  negative regulator of beta-lactamase expression-like protein  37.14 
 
 		 222 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 1089 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.74 
 
 		 280 aa  42  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0421  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  34.67 
 
 		 181 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>