More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3687 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3687  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
394 aa  773    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24017  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1044  acetyl-CoA acetyltransferase  76.4 
 
 
394 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0241668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3890  acetyl-CoA acetyltransferase  71.57 
 
 
396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.908967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2394  acetyl-CoA acetyltransferase  71.07 
 
 
395 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1259  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 
398 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  69.21 
 
 
396 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.394541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0357  acetyl-CoA acetyltransferase  69.54 
 
 
395 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6104  acetyl-CoA acetyltransferase  68.54 
 
 
397 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3610  acetyl-CoA acetyltransferase  68.29 
 
 
399 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3864  acetyl-CoA acetyltransferase  62.09 
 
 
393 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3850  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
393 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  hitchhiker  0.00793734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3938  acetyl-CoA acetyltransferase  62.09 
 
 
393 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.139367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1697  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.75 
 
 
395 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.035668  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09440  acetyl-CoA acetyltransferase  63.36 
 
 
400 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0953135  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1265  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
400 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0810323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1797  acetyl-CoA acetyltransferase  67.26 
 
 
396 aa  461  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28550  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.278957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  68.54 
 
 
399 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0672  acetyl-CoA acetyltransferase  65.81 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4305  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.494714  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4111  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
396 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2198  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462716  hitchhiker  0.000523969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2340  acetyl-CoA acetyltransferase  59.45 
 
 
397 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5999  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
398 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0314319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11355  acetyl-CoA acetyltransferase  60.72 
 
 
389 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000705906  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07600  acetyl-CoA acetyltransferase  60.57 
 
 
402 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2699  acetyl-CoA acetyltransferase  59.33 
 
 
399 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.135058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  61.68 
 
 
398 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2986  acetyl-CoA acetyltransferase  58.81 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31290  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4891  acetyl-CoA acetyltransferase  62.3 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5028  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
393 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5437  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
427 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5467  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
427 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00479259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5475  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
393 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5522  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
427 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5193  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
393 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5044  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
393 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5589  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
393 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5142  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
393 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5485  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
427 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000736039  hitchhiker  2.33e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0618953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3453  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0363  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
394 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
392 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
392 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
395 aa  346  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  346  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3865  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
394 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  48.96 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
392 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 
394 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0400  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
392 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
392 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0522  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
395 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.061167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
392 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
392 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 
393 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  328  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
392 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
392 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
393 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 
393 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
393 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
393 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
393 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
393 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
395 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
393 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
393 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
393 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
393 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
393 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
393 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  45.62 
 
 
392 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
392 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
392 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
392 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 
393 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
393 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
393 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3053  acetyl-CoA acetyltransferase  47.68 
 
 
391 aa  319  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927009  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
392 aa  319  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2669  acetyl-CoA acetyltransferase  45.74 
 
 
391 aa  319  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  0.441381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.5 
 
 
393 aa  319  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
393 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
393 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>